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Plateformes et démonstrateurs du LS2N – Fiche



Plateforme BiRD

La plateforme BiRD est co-dirigée par l’unité de recherche biomédicale "l’institut du thorax" et LS2N. BiRD conseille, propose et développe des services bio-informatiques basés sur des données de séquençage à haut débit. Elle possède une expertise dans l’analyse de données biologiques à grande échelle et développe des pipe-lines bio-informatiques qui standardisent le traitement des données brutes jusqu’à leur interprétation biologique.

Ces services sont soutenus par une infrastructure de calcul et de stockage dédiée, accessible à distance via plusieurs services et ouverte à tous les scientifiques, quelle que soit leur institution d’accueil. BiRD fournit une infrastructure pour la bio-informatique représentant 832 threads, 650TB et 6 TB de RAM (Cluster, OpenStack Cloud). Cette infrastructure offre des services à diverses communautés de biologistes et médecins en s’appuyant sur différentes compétences de recherche fondamentale du LS2N. La plateforme fournit des res- sources bio-informatiques dédiées pour la génomique intégrative et la biologie des systèmes en collaboration avec l’équipe ComBi. La plateforme Cloud est également utilisée pour tester des solutions innovantes en intelli- gence artificielle utilisant des GPU en collaboration avec l’équipe IPI et sur la thématique des conteneurs logiciels sécurisés et de l’exécution répartie d’analyses de données sur infrastructures "cloud" multi-sites en collaboration avec l’équipe STACK. BiRD collabore également avec l’équipe GDD sur l’indexation et la traçabilité des méta- données du web dans un contexte biomédical. Via ses activités de recherche et développements, la plateforme BiRD est membre de l’infrastructure nationale IFB (Institut Français de Bio-informatique).

Responsable : Jérémie Bourdon, Richard Redon
Support Technique : Audrey Bihouée
Contact :
Lien :
Equipe(s) : IPI - DUKe - COMBI - GDD - Stack
Copyright : LS2N 2017 - Mentions Légales - 
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