Intégration de données Modélisation de systèmes / problèmes / données
AAPG PRC

PeptidOMS

Approches numériques innovantes en peptidomique : le pari des stratégies OMS

Développer de nouvelles méthodes d’identification des peptides adaptées à la peptidomique

PeptidOMS développe de nouvelles approches numériques pour améliorer l’identification des peptides issus d’analyses peptidomiques à grande échelle. Le projet répond à un défi majeur de ce domaine émergent : les outils actuels, conçus pour la protéomique, ne prennent pas suffisamment en compte les spécificités du peptidome, ce qui peut entraîner des erreurs d’identification et limiter la fiabilité des analyses.

Le projet conçoit de nouvelles stratégies d’identification et de validation fondées sur les approches Open Mass Search (OMS). Il développe des algorithmes et des méthodes de validation spécifiquement adaptés aux données de peptidomique afin d’améliorer la robustesse et les performances des analyses. Les méthodes proposées sont évaluées dans le cadre de l’étude de l’allergie alimentaire au chanvre, afin d’identifier les peptides susceptibles de présenter un risque allergique.

En développant des outils génériques pour l’analyse des données peptidomiques, PeptidOMS contribue à renforcer la fiabilité des approches de peptidomique et ouvre de nouvelles perspectives pour de nombreuses applications en biologie, en nutrition et en santé.

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Financement

ANR

AAPG PRC

Calendrier

  • Démarrage : 01-10-2024
  • Durée : 48 mois

Coordinateur

  • Responsable scientifique LS2N : Géraldine Jean

Consortium

P1 : INRAE UR1268 BIA – Nantes, France ; P2 : LS2N, UMR CNRS 6004 – Nantes ; P3 : UMR Génétique Quantitative et Evolution (GQE), IDEEV. Univ. Paris Saclay, INRAE, CNRS, AgroParisTech – Le Moulon ; P4: EDyP laboratory, Univ. Grenoble Alpes, CNRS, CEA, INSERM – Grenoble ; P5 (non financé): Computational Omics and Systems Biology Group, VIB-UGent Center for Medical Biotechnology – Ghent Univ., Belgium
Porteur du projet : INRAE