Intégration de données Modélisation de systèmes / problèmes / données
PPR Antibiorésistance

ABROMICS-PF

A numerical platform to store, integrate, analyse and share multi-omics data about antimicrobial resistance

Créer une plateforme nationale pour accélérer la recherche et la surveillance de l’antibiorésistance

L’antibiorésistance constitue l’une des principales menaces pour la santé humaine, animale et environnementale. Pour mieux comprendre l’émergence et la diffusion des résistances aux antimicrobiens, ABROMICS-PF a pour ambition de créer ABRomics, une plateforme nationale fédérant les données, les outils et les acteurs de la recherche dans une approche One Health.

Le projet développe une infrastructure numérique permettant de stocker, partager et analyser des données génomiques, métagénomiques et plus largement multi-omiques issues des secteurs de la santé humaine, animale et environnementale. Fondée sur les principes FAIR, la plateforme associe des bases de données interopérables, des pipelines bioinformatiques standardisés et des outils mathématiques pour intégrer les données, faciliter leur réutilisation et répondre à des questions complexes sur les mécanismes de résistance aux antimicrobiens.

En réunissant chercheurs, cliniciens, laboratoires, agences de santé publique et acteurs de la surveillance environnementale autour d’un environnement commun, ABRomics vise à devenir une infrastructure de référence pour renforcer la surveillance de l’antibiorésistance, accélérer la recherche et favoriser le développement de nouvelles approches diagnostiques et thérapeutiques.

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Financement

France 2030

PPR Antibiorésistance

Calendrier

  • Démarrage : 12-09-2024
  • Durée : 49 mois

Coordinateur

  • Responsable scientifique LS2N : Samuel Chaffron

Consortium

INSERM ; Nantes Université ; CNRS
Porteur du projet : Institut français de bioinformatique (IFB) ; Institut Pasteur (IP)

Site web